تفاوت دیگر انیمیشن و موشن گرافیک را می توان در زمان اجرای آنها دید. از آنجایی که هدف از ایجاد موشن گرافیک، معرفی ویژگی های محصول به بیننده است، زمان نمایش باید کوتاه و در عین حال مفید باشد. اما در زمان دیگری انیمیشن وجود دارد که باید زمان زیادی داشته باشد تا محتوا به درستی به بیننده منتقل شود. تفاوت انیمیشن و موشن گرافیک به دو شرط فوق محدود نمی شود و تفاوت های دیگر نیز در انتقال ایده است. با توجه به ماهیت انیمیشن، داستان باید به اندازه کافی طولانی باشد تا با بینندگان یا غیرمخاطبان ارتباط برقرار کند. موشن گرافیک باید موضوعی را به صورت کوتاه اما مفید به مخاطب منتقل کند. هدف از تولید موشن گرافیک و انیمیشن اصلی ترین تفاوت بین این دو است. از انیمیشن برای ساخت داستان های کارتونی که محتوای خاصی دارند استفاده می شود. اما برعکس، موشن گرافیک است که به هیچ وجه هدف تولید یک کارتون و رساندن داستان به مخاطب را دنبال نمی کند.  برای ساخت انواع تیزرهای تبلیغاتی استفاده می شود. به عبارت دیگر هدف از ساخت موشن گرافیک این است که ویژگی های یک محصول را به نمایش بگذارد تا مخاطب آن محصول را بشناسد.